Создан Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии.

Организован клинический отдел инфекционной патологии, в 1976 году на его базе создано детское клиническое отделение инфекционной патологии.

Институт возглавил профессор, академик АМН СССР, академик РАМН, академик РАН В. И. Покровский. Президент РАМН с 1987 по 2006 гг., почетный заведующий кафедрой эпидемиологии и доказательной медицины Первого МГМУ им. И. М. Сеченова.

Создана специализированная научно-исследовательская лаборатория эпидемиологии и профилактики СПИДа.

Открыта лаборатория молекулярной диагностики инфекционных заболеваний.
Старт развития молекулярной диагностики в России.

Сотрудниками Института организована первая Международная конференция «Молекулярная диагностика».

Организована специализированная клиническая лаборатория для диагностики и контроля лечения инфекционных заболеваний.

Разработаны и зарегистрированы первые в Российской Федерации наборы реагентов для молекулярной диагностики социально значимых инфекционных заболеваний.
Запущено производство молекулярно-биологических диагностических препаратов.
Создан Федеральный научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом.

Создана научно-производственная лаборатория по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных болезней человека и животных, а также научно-консультативное клинико-диагностическое отделение Института.
Организован Всероссийский учебный центр по молекулярной диагностике.

На базе Института создан Центр молекулярной диагностики инфекционных болезней.

Начали функционировать 8 Всероссийских референс-центров по мониторингу за социально значимыми инфекциями: вирусными гепатитами, внутрибольничными инфекциями, сальмонеллезами, острыми кишечными инфекциями, ВИЧ и ВИЧ-ассоциированными инфекциями, бактериальными менингитами, инфекциями верхних и нижних дыхательных путей, инфекциями, передаваемыми половым путем.
Сотрудниками Института основано Национальное научное общество инфекционистов.

Создан Научно-методический центр иммунопрофилактики Роспотребнадзора.

Запуск лабораторно-производственного комплекса Института.

Директором ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора назначен академик РАН, профессор В. Г. Акимкин.
Открыт Международный учебный центр по изучению проблем биологической безопасности на базе Дальневосточного федерального университета.
Организован Референс-центр Роспотребнадзора по остаточному количеству антибиотиков в продовольственном сырье и пищевых продуктах и антибиотикорезистентности бактерий.

Институт вошел в состав Центра геномных исследований мирового уровня по обеспечению биологической безопасности и технологической независимости в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий.

Одной из первых в России запущена в производство высокоточная тест-система для выявления РНК SARS-CoV-2.
Выполняет функцию референс-центра по исследованиям проб на COVID-19 методом ПЦР.
Введен в эксплуатацию Научный центр по профилактике и борьбе со СПИДом ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.
Институт первым в России разработал и запустил в производство набор реагентов для количественного определения возбудителя COVID-19 методом ОТ-ПЦР.

Запуск экспериментально-биологической лаборатории для проведения доклинических исследований генотерапевтических препаратов для борьбы с ВИЧ-инфекцией.
Правительством России Институт назначен центром по сбору данных о результатах расшифровки генома возбудителя новой коронавирусной инфекции (COVID-19).
Правительством России Институт назначен центром по обмену информацией о результатах исследований на наличие возбудителя новой коронавирусной инфекции (COVID-19) с использованием портала Госуслуг.
Выполнено более 4 млн исследований по диагностике COVID-19 методом ПЦР.
3 международные публикации изобретения на выявление ультранизких количеств ДНК ВИЧ с использованием метода редактирования генома.

Создан референс-центр по изучению VZV-инфекции.
Разработана классификация клинических форм новой коронавирусной инфекции (COVID-19) и впервые описан ряд клинических особенностей течения заболевания в зависимости от возраста.
Институт стал девятым международным референс-центром Продовольственной и сельскохозяйственной организации Объединенных наций (ФАО) по устойчивости к противомикробным препаратам.
Создан референс-центр по мониторингу рисков межвидовой передачи патогенных микроорганизмов человеку.