Специалисты лаборатории геномных исследований Центрального НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора разработали инновационную NGS-панель «HBV-seq» для полногеномного секвенирования вируса гепатита В (ВГВ)

Панель состоит из тщательно подобранных праймеров, разделенных на два пула, обеспечивающих амплификацию коротких участков вирусного генома. Процесс секвенирования включает следующие этапы: (1) амплификация фрагментов ДНК ВГВ с использованием специфических праймеров, (2) секвенирование полученных ампликонов на высокопроизводительных NGS-платформах, (3) биоинформатическая обработка данных для получения полной геномной последовательности вируса. «HBV-seq» активно применяется в эпидемиологическом надзоре и клинических исследованиях, проводимых ЦНИИ Эпидемиологии.

Анализ полученных геномных данных позволяет отслеживать пути передачи вируса, оценивать распространенность мутаций, связанных с ускользанием от поствакцинального иммунитета, а также выявлять мутации, обуславливающие устойчивость ВГВ к противовирусным препаратам. На сегодняшний день с помощью «HBV-seq» успешно отсеквенировано более 2000 полных геномов вируса гепатита В.

Таким образом, подход значительно расширяет возможности молекулярно-эпидемиологического мониторинга ВГВ-инфекции, способствуя разработке более эффективных стратегий профилактики и лечения.