Научная группа разработки биоинформатических систем

Руководитель научной группы

Аглетдинов Матвей Рашидович

Основные задачи:

• Разработка, внедрение, валидация, сопровождение и развитие биоинформатических систем, программных модулей, баз данных и вычислительных конвейеров для анализа данных высокопроизводительного секвенирования.
• Методическое сопровождение биоинформатического анализа: выбор алгоритмов и параметров, определение критериев качества, интерпретация и представление результатов.
• Проведение обучения сотрудников других учреждений Роспотребнадзора работе с биоинформатическими программами и анализу данных высокопроизводительного секвенирования.
• Обеспечение качества, воспроизводимости и документированности вычислительного анализа, подготовка технической, эксплуатационной и пользовательской документации.
• Разработка программного обеспечения для медицинских изделий на основе таргетных NGS-панелей, включая обработку данных, контроль качества и интерпретацию результатов секвенирования.
• Развитие информационно-аналитических решений геномного эпидемиологического надзора, включая платформу VGARus.

Научно-исследовательская работа:

• Разработка и валидация алгоритмов и программных решений для контроля качества, обработки и анализа данных высокопроизводительного секвенирования при решении медицинских, эпидемиологических и биологических задач.
• Создание воспроизводимых и масштабируемых вычислительных конвейеров для сборки геномов, выявления генетических вариантов, генотипирования и филогенетического анализа.
• Интеграция геномных, лабораторных и эпидемиологических данных для мониторинга генетической изменчивости возбудителей и изучения путей их распространения.
• Анализ отечественного и зарубежного опыта, апробация новых алгоритмов и вычислительных подходов.